Rota virüs aşısı, çocuklarda ishal nedeni olan rota virüs enfeksiyonlarından korunmak için geliştirilmiştir. Gelişmiş ülkelerin de için de bulunduğu istatistiklerde her yıl 453.000 çocuk ishal enfeksiyonlarına bağlı olarak ölmekte ve 2 milyon çocuk ise hastanelerde yatırılmaktadır. Rota virüs çok hızlı yayılabilen dirençli ve su kalitesini bozan bir virüstür. Dünyadaki her çocuk bu enfeksiyon riskini taşımaktadır. Rotarix ve RotaTEKQ adı verilen iki tane rota virüs aşısı vardır.

Etkili olduğu iddia edilen rota virüs aşısı Hindistan da FAZ3 araştırma seviyesine kadar gelmiştir. 2009 yılında Dünya Sağlık Örgütü ulusal bağışıklama programlarına rota virüs aşısının alınmasını önermiştir. Birçok yetişmiş ülke bu öneriye uyarak rutin bağışıklama programlarında rota virüs aşısına yer vermişlerdir. İlk rota virüs aşısı 1998 yılında ABD de lisans almıştır. ABD, Finlandiya ve Venezuella da yapılan araştırmalar rota virüs aşısının %80-100 oranında rota virüs A'ya bağlı ishalleri engellediğini göstermişlerdir. Ayrıca bu araştırmalarda ciddi bir yan etkiye rastlanmamıştır.

Rotarix insandan elde edilmiş canlı bir aşıdır ve ishal nedeni olan rota virüs G1, G3, G4 ve G9'a karşı etkilidir. Çocuklarda iki doz serisi halinde uygulanır.

RotaTEKQ 5 farklı rota virüs tipi içerir ve oral (Ağız) kullanılır. Ağızdan kullanımı nedeniyle sosyo ekonomik durumu düşük olan bölgelerdeki bağışıklama programlarında kullanımı daha etkilidir. Rota virüs aşısı yapıldıktan sonra üst solunum yolu enfeksiyonları benzeri belirtiler, hafif ishaller 38 dereceyi geçmeyen ateş gibi yan etkiler nadiren de olsa görülebilir. Özellikle kırsal alanda yaşayan temiz su kaynaklarına uzak ve ishal salgınlarının çokça görüldüğü bölgelerde çocuklar ve yeni doğanlar aşılanmalıdır.